Здравствуйте. Вы действительно являетесь налоговым нерезидентом, но по сроку владения освобождаетесь от уплаты налога от продажи квартиры. При продаже Вам не потребуется использовать счёт типа С, так как у Вас имеется Российское гражданство, и сделку по продаже Вы будете проводить, как гражданин РФ. Альтернативная сделка подразумевает одновременную продажу и покупку, что в Вашем случае реализовать не получится. Вам нужно будет получить деньги от продажи объекта в России, затем отправить их в страну пребывания и легализовать там, и только потом приобретать.

"и у меня двойное гражданство. Хочу продать свою квартиру" - российский паспорт остался? если да, тогда продаете вообще без проблем;
"которую я купила в 2003 (...) Попадаю ли я под статус налогового неризидента и должна буду платить 30% от сделки ?" - с 2019 г налоговые резиденты и нерезиденты не имеют отличий. у вас квартира в собственности больше 3/5 лет, соответственно вы продаете без налогов (ст. 217.1 нк рф);
"Возможно ли провести альтернативную сделку : продажа в Подмосковье - покупка в Испании или Португалии?" - основная проблема - вывести деньги из рф. официально или неофициально, каким именно путем - это уже вопрос к вашим возможностям/лабильности. официально "альтернатива" в другой стране российское законодательство не впечатлит ))) выводите деньги, дальше решайте вопрос их легализации в новой юрисдикции, после этого покупайте что хотите